Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK4P11802 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms