Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYBBP04839 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYBBP04839 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms