Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ZBED1O96006 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ZBED1O96006 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ZBED1O96006 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ZBED1O96006 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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