Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3DO95025 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3DO95025 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms