Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRMS1Q9HCU9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1Q9HCU9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms