Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGBD4Q96DM1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms