Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms