Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms