Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms