Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms