Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms