Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms