Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms