Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms