Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC25A52Q3SY17 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms