Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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