Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IHHQ14623 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms