Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms