Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP1A4Q13733 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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