Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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