Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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