Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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