Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms