Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms