Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms