Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms