Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms