Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms