Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAN1Q9Y2M0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAN1Q9Y2M0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms