Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms