Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms