Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms