Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms