Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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