Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms