Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms