Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NLRP9Q7RTR0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP9Q7RTR0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms