Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ZNF493Q6ZR52 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF493Q6ZR52 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms