Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms