Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms