Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms