Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms