Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms