Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms