Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms