Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SREBF2Q12772 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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