Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms