Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms