Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2BFSP57053 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms