Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms